El Laboratorio Nacional de Citometría de Flujo, fue establecido en el 2015 en el Instituto de Investigaciones Biomédicas de la UNAM, gracias al apoyo complementario de Conacyt  para el establecimiento de laboratorios nacionales 2015 y  a la participación de varias Instituciones de la UNAM así como la Universidad Autónoma Benito Juárez de Oaxaca y a partir de 2018 la Universidad Autónoma de Chihuahua que fungen como Instituciones Asociadas.

El LABNALCIT es una Unidad de servicio que permite el análisis cualitativo, cuantitativo, y la separación de poblaciones celulares y bacterianas con un nivel de seguridad 1, 2 y 2+.